أصول فيروس كورونا: تحليل الجينوم يشير إلى أن فيروسين قد اجتمعا

صورة عبر ميشال إيكو / أنسبلاش

أعيد نشر مقال الكسندر حسنين هنا بإذن من المحادثة . تتم مشاركة هذا المحتوى هنا لأن الموضوع قد يثير اهتمام قراء Snopes ، إلا أنه لا يمثل عمل مدققي الحقائق أو المحررين في Snopes.




في غضون أسابيع قليلة ، تعلمنا جميعًا الكثير عن COVID-19 والفيروس الذي يسببه: SARS-CoV-2. ولكن كان هناك أيضًا الكثير من الشائعات. وبينما يتزايد عدد المقالات العلمية حول هذا الفيروس ، لا يزال هناك العديد من المناطق الرمادية فيما يتعلق بأصله.



في أي أنواع الحيوانات حدثت؟ خفاش أم آكل النمل أم نوع بري آخر؟ حيث أنها لا تأتي من؟ من كهف أو غابة في مقاطعة هوبي الصينية ، أو في مكان آخر؟

في ديسمبر 2019 ، مر 27 من أول 41 شخصًا تم نقلهم إلى المستشفى (66٪) عبر سوق يقع في قلب مدينة ووهان في مقاطعة هوبي. لكن بحسب أ دراسة أجريت في مستشفى ووهان ، فإن أول حالة بشرية تم تحديدها لم تكن متكررة في هذا السوق. في حين أن، تقدير التأريخ الجزيئي بناءً على التسلسل الجيني لـ SARS-CoV-2 يشير إلى أصل في نوفمبر. يثير هذا تساؤلات حول الصلة بين وباء COVID-19 والحياة البرية.



البيانات الجينومية

ال جينوم SARS-CoV-2 تم تسلسله بسرعة من قبل الباحثين الصينيين. إنه ل RNA جزيء من حوالي 30000 قاعدة تحتوي على 15 جينًا ، بما في ذلك الجين S الذي يرمز إلى بروتين موجود على سطح الغلاف الفيروسي (للمقارنة ، يكون جينومنا في شكل حلزون مزدوج من الحمض النووي يبلغ حجمه حوالي 3 مليارات قاعدة ويحتوي على حوالي 30000 جين).

مقارنة التحليلات الجينية أظهرت أن SARS-CoV-2 ينتمي إلى مجموعة فيروسات بيتاكورون وأنه قريب جدًا منه فيروس السارس ، المسؤول عن وباء الالتهاب الرئوي الحاد الذي ظهر في نوفمبر 2002 في مقاطعة جوانجدونج الصينية ثم انتشر إلى 29 دولة في عام 2003. تم تسجيل إجمالي 8098 حالة ، بما في ذلك 774 حالة وفاة. ومن المعروف أن الخفافيش من الجنس رينولوفوس (من المحتمل أن تكون عدة أنواع من الكهوف) هي خزان هذا الفيروس وهذا حيوان آكل لحوم صغير ، زباد النخيل ( يرقات باجوما ) ، قد يكون بمثابة جمهور محايد بين الخفافيش وأول الحالات البشرية.

منذ ذلك الحين ، كثير فيروسات بيتاكورون تم اكتشافه ، بشكل رئيسي في الخفافيش ، ولكن أيضًا في البشر. على سبيل المثال ، RaTG13 ، معزول عن خفاش من الأنواع Rhinolophidae ذات الصلة التي تم جمعها في مقاطعة يونان الصينية ، تم وصفها مؤخرًا بأنها مشابهة جدًا لـ SARS-CoV-2 ، مع تسلسل الجينوم مطابق لـ 96٪ . تشير هذه النتائج إلى أن الخفافيش ، وخاصة الأنواع من الجنس رينولوفوس ، تشكل خزان فيروسات SARS-CoV و SARS-CoV-2.



واحد، Rhinolophidae ذات الصلة .
Alexandre Hassaninوقدم المؤلف

لكن كيف تحدد الخزان؟ المستودع هو نوع واحد أو عدة أنواع حيوانية ليست حساسة للغاية للفيروس أو ليست حساسة للغاية ، والتي ستستضيف بشكل طبيعي فيروسًا واحدًا أو أكثر. يفسر عدم وجود أعراض المرض من خلال فعالية جهاز المناعة لديهم ، مما يسمح لهم بمكافحة انتشار الفيروس بشكل كبير.

آلية إعادة التركيب

في 7 فبراير 2020 ، علمنا أنه تم اكتشاف فيروس أقرب إلى SARS-CoV-2 في البنغول. بنسبة 99٪ ذكرت التوافق الجينومي ، هذا يشير إلى وجود خزان محتمل أكثر من الخفافيش. ومع ذلك ، أ الدراسة الأخيرة قيد المراجعة يوضح أن جينوم الفيروس التاجي معزول عن البنغول الماليزي ( مانيس جافانيكا ) أقل تشابهًا مع SARS-Cov-2 ، مع 90٪ فقط من التوافق الجيني. قد يشير هذا إلى أن الفيروس المعزول في البنغول ليس مسؤولاً عن وباء COVID-19 المستشري حاليًا.

ومع ذلك ، فإن الفيروس التاجي المعزول من البنغولين يتشابه بنسبة 99٪ في منطقة معينة من البروتين S ، وهو ما يتوافق مع 74 من الأحماض الأمينية المشاركة في مجال ربط مستقبلات الأنجيوتنسين 2 (ACE) ، وهو المجال الذي يسمح للفيروس بالدخول الخلايا البشرية لإصابتها. على النقيض من ذلك ، تم عزل الفيروس RaTG13 من الخفافيش R. ذات الصلة شديد التباين في هذه المنطقة المحددة (77٪ فقط من التشابه). هذا يعني أن الفيروس التاجي المعزول من البنغولين قادر على دخول الخلايا البشرية بينما الشخص المعزول من الخفافيش R. ذات الصلة ليس.

بالإضافة إلى ذلك ، تشير هذه المقارنات الجينية إلى أن فيروس SARS-Cov-2 هو نتيجة إعادة التركيب بين فيروسين مختلفين ، أحدهما قريب من RaTG13 والآخر أقرب إلى فيروس البنغولين. بمعنى آخر ، إنه وهم بين فيروسين موجودين مسبقًا.

يمكن أن يكون فيروس كورونا من حيوان آكل النمل الحرشفي أحد مصادر COVID-19.
تحالف الحياة البرية / فليكر و CC BY

كانت آلية إعادة التركيب هذه سبق وصفه في فيروسات كورونا ، على وجه الخصوص لشرح أصل فيروس السارس. من المهم معرفة أن إعادة التركيب ينتج عنه فيروس جديد قادر على إصابة أنواع مضيفة جديدة. من أجل حدوث إعادة التركيب ، يجب أن يكون الفيروسان المتباينان قد أصابا نفس الكائن الحي في وقت واحد.

يبقى سؤالان بلا إجابة: في أي كائن حي حدث إعادة التركيب؟ (خفاش أم آكل النمل أم نوع آخر؟) وفوق كل ذلك ، تحت أي ظروف تمت عملية إعادة التركيب هذه؟


Alexandre Hassanin ، أستاذ مشارك (HDR) في جامعة السوربون ، ISYEB - معهد النظاميات ، التطور ، التنوع البيولوجي (CNRS ، MNHN ، SU ، EPHE ، UA) ، المتحف الوطني للتاريخ الطبيعي (MNHN)

تم إعادة نشر هذه المقالة من المحادثة بموجب رخصة المشاع الإبداعي. إقرأ ال المقالة الأصلية .